Для нумерации строк запроса необходимо воспользоваться встроенной функцией АВТОНОМЕРЗАПИСИ().
Её можно использовать только во временных таблицах.
Ниже приведен небольшой пример:
Нужно выбрать все элементы справочника Тест и пронумеровать их. Создаем новое поле в запросе и забиваем в него функцию. Создаем временную таблицу и в последующей выборке получаем нужный результат.
ВЫБРАТЬ
Тест.Ссылка КАК Ссылка,
АВТОНОМЕРЗАПИСИ() КАК Номер
ПОМЕСТИТЬ ВТ
ИЗ
Справочник.Тест КАК Тест ;
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
ВЫБРАТЬ
ВТ.Ссылка КАК Ссылка,
ВТ.Номер КАК Номер
ИЗ
ВТ КАК ВТ